卵巢囊肿小且良性的，可以正常受孕，但有的卵巢囊肿虽小，亦会影响盆腔内环境及输卵管功能，干扰卵子的排出和运输，如巧克力囊肿。

较大的卵巢囊肿会破坏卵巢组织，影响卵巢功能及卵子发育，造成不孕，同时较大的囊肿怀孕后也有破裂及扭转的风险。当怀疑卵巢囊肿是恶性的，可能需要切除卵巢造成不孕。所以，当发现卵巢囊肿时，要积极就医进行评估。

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